Protein–RNA interactions for Protein: P34981

TRHR, Thyrotropin-releasing hormone receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHRP34981 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRHRP34981 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRHRP34981 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRHRP34981 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRHRP34981 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms