Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PSMB4P28070 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PSMB4P28070 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PSMB4P28070 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PSMB4P28070 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PSMB4P28070 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PSMB4P28070 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PSMB4P28070 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PSMB4P28070 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PSMB4P28070 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PSMB4P28070 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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