Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNA2P26232 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms