Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LMO2P25791 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
LMO2P25791 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms