Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PSMA1P25786 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms