Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms