Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms