Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PALD1Q9ULE6 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms