Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHPF2Q9P2E5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms