Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
C1orf109Q9NX04 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
C1orf109Q9NX04 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms