Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCAPERQ9BY12 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms