Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms