Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP13Q92995 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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USP13Q92995 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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USP13Q92995 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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USP13Q92995 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP13Q92995 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP13Q92995 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP13Q92995 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP13Q92995 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP13Q92995 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP13Q92995 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP13Q92995 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP13Q92995 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP13Q92995 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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