Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDXQ7Z353 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms