Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.7 ms