Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms