Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms