Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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