Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FXNQ16595 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FXNQ16595 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FXNQ16595 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FXNQ16595 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FXNQ16595 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FXNQ16595 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FXNQ16595 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FXNQ16595 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FXNQ16595 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FXNQ16595 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FXNQ16595 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FXNQ16595 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FXNQ16595 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FXNQ16595 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FXNQ16595 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FXNQ16595 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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