Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms