Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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RAB35Q15286 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB35Q15286 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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