Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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