Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ATRQ13535 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ATRQ13535 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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