Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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