Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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