Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCB1Q12824 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SMARCB1Q12824 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SMARCB1Q12824 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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SMARCB1Q12824 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMARCB1Q12824 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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SMARCB1Q12824 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCB1Q12824 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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SMARCB1Q12824 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCB1Q12824 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCB1Q12824 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCB1Q12824 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCB1Q12824 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCB1Q12824 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCB1Q12824 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCB1Q12824 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCB1Q12824 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCB1Q12824 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCB1Q12824 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCB1Q12824 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCB1Q12824 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCB1Q12824 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCB1Q12824 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCB1Q12824 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCB1Q12824 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMARCB1Q12824 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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