Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EGR3Q06889 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EGR3Q06889 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EGR3Q06889 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EGR3Q06889 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EGR3Q06889 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
EGR3Q06889 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EGR3Q06889 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EGR3Q06889 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EGR3Q06889 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
EGR3Q06889 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EGR3Q06889 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EGR3Q06889 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EGR3Q06889 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
EGR3Q06889 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EGR3Q06889 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EGR3Q06889 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EGR3Q06889 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EGR3Q06889 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EGR3Q06889 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms