Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSME1Q06323 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 363 ms