Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms