Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DEFA5Q01523 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms