Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF6P49848 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TAF6P49848 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms