Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJC1P36383 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJC1P36383 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJC1P36383 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJC1P36383 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJC1P36383 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJC1P36383 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJC1P36383 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms