Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTN2P35609 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms