Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HOXD12P35452 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HOXD12P35452 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HOXD12P35452 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HOXD12P35452 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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