Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BRAFP15056 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRAFP15056 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRAFP15056 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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