Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
IFITM1P13164 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
IFITM1P13164 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms