Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRRT4C9JH25 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms