Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SOBPA7XYQ1 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SOBPA7XYQ1 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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