Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms