Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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