Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms