Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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CNTN3Q9P232 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CNTN3Q9P232 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CNTN3Q9P232 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CNTN3Q9P232 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CNTN3Q9P232 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CNTN3Q9P232 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CNTN3Q9P232 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CNTN3Q9P232 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CNTN3Q9P232 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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CNTN3Q9P232 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CNTN3Q9P232 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CNTN3Q9P232 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN3Q9P232 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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