Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC3GQ9HC16 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms