Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLVAPQ9BX97 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLVAPQ9BX97 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms