Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC94Q9BW85 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms