Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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