Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGF29Q96ES7 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGF29Q96ES7 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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