Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms