Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP2A3Q93084 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms