Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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